Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DKK2Q9UBU2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DKK2Q9UBU2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms