Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNAL1Q9UBT7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms