Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
POLKQ9UBT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLKQ9UBT6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
POLKQ9UBT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms