Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VPS29Q9UBQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS29Q9UBQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS29Q9UBQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms