Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPASTQ9UBP0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPASTQ9UBP0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms