Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCDNQ9UBB6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCDNQ9UBB6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCDNQ9UBB6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCDNQ9UBB6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCDNQ9UBB6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCDNQ9UBB6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCDNQ9UBB6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCDNQ9UBB6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms