Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SENP1Q9P0U3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP1Q9P0U3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP1Q9P0U3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms