Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GDE1Q9NZC3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDE1Q9NZC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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