Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNAH9Q9NYC9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAH9Q9NYC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms