Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGPEP1Q9NXJ5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms