Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDL2Q9NX52 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDL2Q9NX52 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms