Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVN3

RIC8B, Synembryn-B, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIC8BQ9NVN3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIC8BQ9NVN3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIC8BQ9NVN3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIC8BQ9NVN3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIC8BQ9NVN3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIC8BQ9NVN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIC8BQ9NVN3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIC8BQ9NVN3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIC8BQ9NVN3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIC8BQ9NVN3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIC8BQ9NVN3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms