Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DNAJC11Q9NVH1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC11Q9NVH1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms