Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO28Q9NVF7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FBXO28Q9NVF7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms