Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCM2LQ9NUG4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCM2LQ9NUG4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms