Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GINM1Q9NU53 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GINM1Q9NU53 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GINM1Q9NU53 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms