Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPHNQ9NQX3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GPHNQ9NQX3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms