Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EXOSC3Q9NQT5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC3Q9NQT5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms