Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TIMMDC1Q9NPL8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TIMMDC1Q9NPL8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms