Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNK9Q9NPC2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNK9Q9NPC2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms