Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMURF1Q9HCE7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMURF1Q9HCE7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms