Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLK4Q9HAZ1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLK4Q9HAZ1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms