Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C10orf88Q9H8K7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C10orf88Q9H8K7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms