Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SCAF1Q9H7N4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SCAF1Q9H7N4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms