Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRDQ9H2X0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRDQ9H2X0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRDQ9H2X0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms