Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLIRPQ9GZT3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLIRPQ9GZT3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms