Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTNAP4Q9C0A0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTNAP4Q9C0A0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms