Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SHANK3Q9BYB0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SHANK3Q9BYB0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SHANK3Q9BYB0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms