Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AGPAT1Q99943 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms