Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LYSTQ99698 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LYSTQ99698 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms