Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTC1Q99614 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTC1Q99614 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms