Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ELF4Q99607 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ELF4Q99607 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ELF4Q99607 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms