Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SORT1Q99523 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORT1Q99523 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORT1Q99523 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms