Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC22A12Q96S37 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC22A12Q96S37 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms