Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C9orf72Q96LT7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C9orf72Q96LT7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms