Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PRAC1Q96KF2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms