Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF479Q96JC4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF479Q96JC4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms