Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK5RAP3Q96JB5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms