Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TPD52L3Q96J77 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TPD52L3Q96J77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TPD52L3Q96J77 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms