Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SHDQ96IW2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHDQ96IW2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms