Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIN37Q96GY3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms