Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RNFT2Q96EX2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RNFT2Q96EX2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms