Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC51Q96ER9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC51Q96ER9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms