Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHFRQ96EP1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHFRQ96EP1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms