Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MRPL53Q96EL3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL53Q96EL3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms