Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MTERF3Q96E29 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms