Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RMDN1Q96DB5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RMDN1Q96DB5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms