Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
OPTNQ96CV9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
OPTNQ96CV9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms