Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN5

LRRC45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC45Q96CN5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC45Q96CN5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC45Q96CN5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC45Q96CN5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms