Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NEO1Q92859 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEO1Q92859 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEO1Q92859 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms